De avião: todos os voos aterram e partem do aeroporto Internacional situado a poucos quilómetros do centro da cidade de São Tomé. A frequência de voos internacionais é mais regular. Para viajar para São Tomé conta hoje com várias alternativas ao longo da semana.
| Companhia | Voo | Frequência/semana | Web |
| Air Luxor | São Tomé - Lisboa (Portugal) | 2 |  |
| Air São Tomé | São Tomé - Principe | 4 | |
| Air São Tomé | São Tomé - Libreville (Gabão) | 4 | |
| Air Service | São Tomé - Libreville (Gabão) | 2 | |
| LAS | São Tomé - Lagos (Nigeria) | 1 | |
| LAS | São Tomé - Douala (Cameron) | 1 | |
| LAS | São Tomé - Brazaville (Congo) | 1 | |
| TAAG | São Tomé - Sal (Cabo Verde) | 1 | |
| TAAG | São Tomé - Luanda (Angola) | 1 | |
| TAP | São Tomé - Sal (Cabo Verde) - Lisboa (Portugal) | 1 | |
À saída de São Tomé é cobrada no acto do check in a taxa de aeroporto no valor de 20 $.